隨著流式細胞術的日益發展，流式抗體及熒光標記產品的種類、數量也在不斷增多，加上多色分析實驗方案需求的增長，逐漸產生了抗體難選擇、熒光難搭配等問題，如何選擇合適的流式抗體，也成為了流式技術是否能成功的關鍵因素之1。
流式抗體的選擇：
1、流式抗體本身也是抗體，所以選擇流式抗體定要滿足抗體選擇最基本的條件：目標蛋白特異性，反應種屬以及應用實驗。
2、流式抗體熒光標記的方式包括直接標記和間接標記兩種。在流式實驗過程中，盡量減少實驗工序和過程，以保證實驗的真實和準確性。因此在條件允許的范圍內，建議盡量用直接標記的抗體進行實驗而不去做間接標記。
3、流式抗體熒光標記的選擇：如果實驗中檢測單指標：不同熒光標記在不同的儀器上強度不同。FACS Calibur儀器為例：PE ＞APC ＞PE-Cy5 ＞PerCP ＞FITC ＞PerCP-Cy5.5，通常來說，PE*，適用于弱表達抗原。FITC強度較弱，適用于強表達抗原，使用范圍比較廣。用戶需根據檢測的目標蛋白進行具體選擇。如果同時檢測多個指標：確認流式細胞儀能檢測多少個通道：流式抗體每個通道只能選擇1種熒光素。各個通道之間的熒光素可以隨意搭配。如：實驗者同時檢測三個指標，可以在圖1中綠色、黃色和紅色三個通道中各選個適當的熒光素標記，FITC、PE和PE-cy5。切忌所有指標選擇同個通道的熒光標記，以防止熒光的重疊和相互干擾，影響最后結果。因此，流式細胞儀的通道越多，同份樣本能同時做的表面/胞內標志就越多。常用熒光標記包括FITC, PE, PEcy5, PEcy5.5, APC等。
流式抗體的選擇使用注意事項：
1、建議實驗細胞的數量和抗體的比例要適當。細胞過量或抗體過量都可能使實驗結果受影響，因此需要優化試驗條件。注：不同的流式技術對抗體的需求量有較大差異，例如傳統流式細胞術（采用鞘液流系統）需要1×106個細胞為起始上樣量，抗體用量為10μl，而微流式細胞術則只需5×105個細胞，抗體用量減少到5μl。
2、 直標的流式抗體應該4℃避光保存，不要冷凍。
3、 盡量選擇經實驗驗證的流式抗體，以保證實驗結果。
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